El Tribunal Supremo Electoral (TSE) concluyó el conteo de votos Legislativos correspondientes a los departamentos de San Vicente, Cabañas y Morazán, conteo que tuvo dificultades en el sistema informático presentado en algunas mesas del escrutinio, además de presentar una incoherencia en la cantidad de papeletas que habían sido ingresadas y utilizadas durante las elecciones.
El TSE solo liberó los resultados de dos de los tres departamentos contabilizados, las actas que fueron publicadas pertenecientes al departamento de Cabañas, fueron 104 actas del municipio de Cabañas Este y 27 actas del municipio de Cabañas Oeste, siendo un total de 131 de 228 paquetes, lo que corresponde a un porcentaje del 57.4% del total de actas pertenecientes a este departamento.
Mientras que en San Vicente hubo 97 actas de San Vicente Norte y 54 actas de San Vicente Sur, dando como resultado un total de 205 de 246 paquetes, equivalentes a un porcentaje del 83% del total de actas. Por otro lado dentro de las anomalías que se presentaron en el sistema estaría la caída de este en algunas mesas de conteo, al momento que se generaba la caída se llamaba a soporte técnico, este inconveniente se habría registrado en al menos cinco mesas de los salones A y B donde se digitaban datos pertenecientes al departamento de Cabañas.
Otro de los problemas que se suscitaron durante el conteo fue la alerta en algunas máquinas donde se podía observar el mensaje que hacía referencia a que la cantidad de papeletas recibidas no concordaba con las papeletas utilizadas. Siendo así que la JRV recibió 700 papeletas de las cuales ingreso 692, mientras que la cantidad que había sido entregada a los votantes había sido solamente de 333 y esa cantidad solo 325 fueron válidas. Al momento han sido los únicos inconvenientes que se han generado en el sistema y se espera que se continúe con el conteo de los departamentos de Chalatenango, Cuscatlán y la Unión.