El lago de Coatepeque está empezando a cambiar su tono a un color turquesa, una característica recurrente en los últimos años, las autoridades correspondientes mantienen un monitoreo constante de esta área natural protegida.
Desde su cambio de color, los equipos de guardarrecursos y técnicos del MARN han tomado muestras de agua y material particulado sedimentado de diferentes puntos del espejo de agua y sus riberas para obtener evidencias químicas y ver la composición elemental de las muestras. El ministerio menciona que los primeros análisis de las muestras descartan que el cambio del agua del lago sea provocado por actividad volcánica.
El cambio de coloración en el agua tiene relación con un alto grado de asociación con el incremento de unidades de PH en el agua, que están arriba de 9, lo que hace disminuir su calidad para usos domésticos y de riego.
Así mismo los técnicos del MARN, recomiendan a los visitantes tener precaución en actividades recreativas, ya que podría ocasionar afectaciones en la piel, principalmente a aquellas personas con piel sensible.